mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTCGAAGGCTTCCAATATA TGTTGGAAACCCTAGGGGGAGG AAATGGAGAAGCTTCCAACCTCCCTCGAAGGCTTCCAATATACCATGCTTCCTCANATTGGCCTTGTAAGCATGGGAATGTTGGAAACCCTAGGGGGAGGTTGAAAGCTTATGACTCCATTTAAATCAGTCTGTACGTG 5 0 5' arm Citrus_sinensis mirbase MIR477 0.00003 csi-MIR477a 3e-73 -62.5 ((((((((((((((.(((((((((((...((.(((((((((.((((((((((.......))......))))))))..))))))))).))...))))))))))).))))))....))))))))................. (-62.50)