mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGTGGGAGTGGGAGTAGGGTG TCCTAATTATTTGTTTACTTTGTC AGGAGTGTGGAGTGGGAGTGGGAGTAGGGTGTTTACTTAGACTAAATGAAAGTATGGATTATCAATCAGAATCCTAATTATTTGTTTACTTTGTCTTGGATTGGGAGTAAATTATTTTAAATTATAATTTTATCCTTATGTACAAAATTATAA 4 4 5' arm Citrus_sinensis mirbase 100 100 -23.89 ..(((.(..((((((((((((...((((((.......(((.(((.((....)).))).))).........)))))).))))))..))))))..))))..((.((((..(((((((........)))))))..)))).)).............. (-23.89)