mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCATGCATA ATATTATATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGCCCAACGGATCCTCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCGCA 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-160 2e-42 ptc-MIR160c 7e-42 -51.3 .......((((((.(((((((..((((((((((..(.(((.(((.(((....))).))).))).)..))))))))))..))))))).))))))..... (-51.30)