mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCGAGGAGCCAAGCATA AAATGGGTTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCACAGCAAAGACCAATCTCTTCTGTCTTAGATTGGCTGCTGCCGGTGGCGTGCGAGGAGCCAAGCATACTCTCT 2 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-160 4e-44 ptc-MIR160a 1e-34 -53.1 ....((((.((((.(((((((.((((((((((.(((.((.(((((((..........)))))))))..)))..)))))))))).))))))).))))))))... (-53.10)