mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA GCATGAGGGGAGTCGAGCAGG AAGAATGGCCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAGGAAGCTTGTCAAAGAGTGTTGGCAACCTTTCTATTTGGCATGAGGGGAGTCGAGCAGGCCAATT 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-160 0.00000000000002 ptc-MIR160f 3e-35 -60.7 .....((((((((.(((((((((..((((((..(((((((.(((((((......))))))).)))))))..))))))..))))))))).))))))))... (-60.70)