mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGAATGCCA GCATGAGGGGAGTCACGCAGG AAGAATGGTCTGCCTGGCTCCCTGAATGCCATCTAGGAAGCTTGTCAAAGAGTGTTGGCAACCTCTCTAACTGGCATGAGGGGAGTCACGCAGGCCCAAC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-160 0.000000001 ptc-MIR160e 3e-35 -53.3 ......(((((((.(((((((((..((((((..(((..((.(((((((......))))))).))..)))..))))))..))))))))).))))))).... (-53.30)