mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACATGCT CATGTGCTCTATCTCTCCAGC TGAGCCATGCTGGAGAAGCAGGGCACATGCTAAATCTATCAGCTTGAAAGTCTGATAGTTTTGCATGTGCTCTATCTCTCCAGCTTGGAC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR164 8e-45 tcc-MIR164c 0.00000000002 -48.7 ....(((.((((((((.(.(((((((((((.(((.(((((((((....)).))))))).)))))))))))))).).)))))))).))).. (-48.70)