mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTT GGAATGAAGTTTGATCCAAGA AAGGGGTGTTTGGAATGAAGTTTGATCCAAGATCCTTGTCTCTCCCGTTAACTTAGTCTCTGTTACTGTTAGGTTTTCATTACTGAGTGTATTTGCAGCCCCCTTGTCTGATTTTAGCATCATGAGAGTAGGAAGTGCTGGTGATCATAGGGTTTGGTTCAAGATCCATTTGACTCTTCTCTTTATATCTCTCCTGTGTCCTAGCTGGTAATCTGTAGTAGTCTTAATTATCCCTTACTTCTTGTTAATTTTTAGGTTTGATCTTGCAAGTAATTATATTTGGAAAATATCATAAAATGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTTACACCTTG 4 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-166 0 ptc-MIR166o 9e-26 -88.62 ..(((((((..(((((((((((((.(((.(((((..((....(((.....(((((((...((..(((....)))...))..))))))).(((((((((........(((((..((((((....((.((((((....(((((.((.(((((((...(((..((((...............))))...)))..)))))))))))))).((((((....((....))..)))))).)))))))).))))))...))))).......))))))))).........)))......))......))))).))).)))))))))))))..))))))). (-88.62)