mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTT GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG TTAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATTGAGGCCATGATTATACAGACATGGCATTACCTGATGACAGCCGAGAAAATTCAAAGTCTGTGTGTATCTTGTACCTCGATGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCTTCCAACAAA 5 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase mir-166 8e-77 ptc-MIR166p 2e-21 -67.54 ....((((..(((((((..((((((..((((((((((((((.((.((((((((((((..(((..............)))..((....))...))))))))).))).))..))))))))).)))))..))))))..)))))))..))))... (-67.54)