mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCATCTCTGGCTACT TTATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGAATAAGCTATGATCAATAGCTATAGCTATGGTATTTTTCATCCTAGGTTTGGCTATATATATATATATATATAGCCAGTTAATTGCTATAAATCTCAGCACATTTATGTTTTATATGTCTGCACACAGACACACACATCATTGAATGTTGATGTTCCACCTCCTATGATCAGTAGTCAATCGGCAAGTCATCTCTGGCTACTCAACTC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_2 2e-97 vvi-MIR169w 0.0000000002 -78.64 ....((.(.(.(((((..(((((((((((((.....((((((((((.(((.((((((.((((......)))).......(((((((((((((....)))))))))))))......))))))....((((((.....(((.......((((((....)))))).......)))....))))))...........))))))))).))))...)))))))))))))..))))).).).)).. (-78.64)