mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGCCCTTGGCTACA GAGTGTAATTCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCACGGGATCTCAGAGCTTAATAACTAGAAGATCAAGGCTGTCATTACTTTTCCGGCCGGCAAGTTGCCCTTGGCTACATTGTAC 3 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_2 2e-61 ptc-MIR169s 0.00000000002 -46.76 ..(((((((..((((((((..((((((((((((((.(..(((((...((........))...)))))..))))...............)))))))))))..))))))))..))))))) (-46.76)