mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAACT TCTTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCATTGTAGGAGGTTTCCGAAAAAATGCAGACATGTATAATTTCGAAACCCCTGTTTCGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTAACTTGACTG 0 3 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_5 2e-64 ptc-MIR169m 2e-24 -52.69 ....(((.((((((((((((.((((.(((((........((((.((((((.((((..(((((....)))))..))))))))))))))........)))))))))))))))))).))).))).. (-52.69)