mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG AGCAAGTGTCCTTGGCTAACG TCTTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTAGCCTCCCTCGGATTCATGAACACGAGCATTTATGTGGTGCTCAAAAGAAAAGGAGAGAATGATCCCAGCTGGCAGCGACAAGGTCAATCCATTGAAGTAGCGAGAAGCAGGTGATTTATAGCTAGAATCCACAAGAGGTTCCCAGCAAGTGTCCTTGGCTAACGAGACGG 2 2 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_2 7e-112 ptc-MIR169m 0.0000000002 -74.1 ...(((((.((((((((((((.((((((..(.((((((....((((((........(((((((.....)))))))...........((.....((((((.(((.((.((..(((((.....)).)))..)).))....))).)).)))).....)).))))))....)))))).)..)))))))))))))))).)).))))). (-74.10)