mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAGGATGACTTGCCG GCAAGCATCCTTGGTTCTCC AGAGTGGATTTGAGCCAAGGATGACTTGCCGCAGATGCATGGTCCTTGCTGCTGATCACATACCAAGGGGGGTTTTGGGTGGCAAGCATCCTTGGTTCTCCTTCGCT 1 1 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_2 7e-55 vvi-MIR169o 0.000000001 -48.1 ..((((((...((((((((((((.((((((((.((.((....((((((.((.((....)))).))))))..)).))..))))))))))))))))))))...)))))) (-48.10)