mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGAAGTCAACCTTGGCTTTC CCTTGCGTGGAAGCCAAGGATGACTTGCCTGAGAATTTTAGGAAGGTTTCTATATGAAAGCTTTTTATTAGTTTTGCAGGAAGTCAACCTTGGCTTTCCTATAG 1 1 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_5 4e-53 ptc-MIR169o 2e-54 -45.6 ......(.(((((((((((.((((((.((((((((((.(((((((.((((.....)))).)))))))..)))))).)))))))))).))))))))))))..... (-45.60)