mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGCCAAGGATGACTTGCCG GCAAGCTGTCCTTGGCTACAT AGAGTGTGATTCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAGCAGGTAAGAGCAAAGCTCCGTTTTTGGAAGTTCAAGGATATCTTAACTTTTCCGGCCGGCAAGCTGTCCTTGGCTACATTGTACT 4 0 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_2 1e-62 ptc-MIR169h 0.00000000003 -53.7 ..((((..((..((((((((((..(((((((((....((.(((((..(((....((((((((....))))))))..)))..))))))).)))))))))..))))))))))..))..)))) (-53.70)