mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCCA GGCAGTCATCTTGGCTATG CGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCACTCCATTGAAAGAGTTTTTCAAGCATATGGTAGTGTAGAACTTTTCTTTGGTTCTGGGCAGTCATCTTGGCTATGCTGAC 0 2 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_5 1e-56 ptc-MIR169w 2e-17 -44.1 ........(((((((((.((((((.(((((..(((..(((.(((((((....((((......))))))))))))))..)))...))))))))))))))))))))...... (-44.10)