mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCATGGATGAATTGCCTG GGCAGTCATCAGCTTGGCTAACT TCTTGTTTAGTAGCCATGGATGAATTGCCTGCTTCCAAAATGAGGTGTCAAGCCGAGATAAACATACAAGTTTGATCCCTCATTGGGGTTCCCAGGCAGTCATCAGCTTGGCTAACTTGACAG 2 4 5' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR169_5 2e-64 bna-MIR169l 0.00002 -50.59 ...((((.((((((((..(((((.(((((((...((..(((((((..((((((................))))))..)))))))..))....))))))))))))....))))).))).)))). (-50.59)