mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG GGATATTGGTACGGTTCAATC TCAGAGAAAACGGGATATTGGTACGGTTCAATCAGAAAGTAATGCTCCCAAAAGTATAGAGTACTATTGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTACACTCAT 1 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR171_1 3e-20 ptc-MIR171b 6e-24 -49.8 ...(((...(((.(((((((((((((((((((((((.((((.(((((...........))))).)))).))))))))))))))))))))))).)))...))).. (-49.80)