mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGCCTGGTTCACTCAGA GAGTGACTATGATATTGGCCTGGTTCACTCAGATCACGACTTCAGAGCAAAGTGTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTTTTATGTTCGTTTGATTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTACTC 2 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR171_1 3e-17 zma-MIR171d 0.0000000004 -43.29 (((((.((..(((((((((.(((((((.(((((((((((.(..(((((((............................)))))))..).))))..))))))).))))))).)))))))))..))))))) (-43.29)