mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGATTGAGCCGCGCCAATATC TACTGGCTCGGTTCAACCTCA GATACTGGCTCGGTTCAACCTCATCGTAGTCTTGATGAATGATTCAAATCTATGGTTGGATTGAGCCGCGCCAATATC 3 0 3' arm Populus_trichocarpa mirbase MIR171_1 1e-37 ptc-MIR171j 7e-20 -34.4 ((((.((((.((((((((.((.(((((((..((((........))))..))))))).)).)))))))).)))).)))) (-34.40)