mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCATGCATA TATACCTATGTCTATATATTTATAATTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCCATGTATAATATATACCCATAGAT CTTTCTCTCACAAAAATAAATTTAAAAAAACCACAAAAAAATTGGCCTAGCTTCTATCTTCCTTCATCCCCTATGTTTAGCTTCTTGTCTTGCTTGTTTCATGCCAATTTCAAAGGGCATGTGTTCAAATAACTTGAACACCCCACAATTAATTTGATTATGAGCCTCATGAGCTCCTAATATTTGCCTCAGATCTCTGTTTATCTACTTAAATCTTTTCTAGCTCTGGATATTTATGATCATGAAGCACCACAAGGCATTTCTTGTCCATGCAAACATTCAGAATCCCATTAATTGATGCACATATTCGTAAACACATGCATATATGAGTTACAAAATCATGCATATTATACCTATGTCTATATATTTATAATTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAGAGTCAATCGAAACATCGATGGCCTCCGTGGATGGCGTATGAGGAGCCATGCATATTCCATGTATAATATATACCCATAGATATGGATTCTTGATTTTTTTTTGCAGGTTAATTTTTTTTTTCATTTCTTCCAACTTGACAAGGGCAGCATTGTAATTTTGTAAGATGCAGGGTTCACTCTTTGTGCCTAAAAGGTACAATCAATCTCTCATGTTCTTCTTTAATTCTTTCGAATTAGTCCTTTTATGGATTTTAGGGTTTCAGTGATGAGACATTTTGTGAAAGCATAATTAATATCCATGACACCTGTAACGAGGAATTGTATATTACACTGAATTTGACATCGCAAGAGTTTCATCAGCTAATTAAATGTTTCCCATTTTATTGATCCATCATCTTATTACACACT 2 0 5' arm Citrus_sinensis mirnest mir-160 7e-28 csi-MIR160 4e-75 -51.3 .....(((((..((((((((((((...((((((.(((((((.((((((((((((((.(((...(((((....)))))...))).)))))))))))))).))))))).))))))....)))).))))))))..))))).. (-51.3)