mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTGCCTACTCCTCCCATT ATGGGAGAGTATGCAAGAAG GAGTCCTAGCAAGTCTTTGGAGATGGGAGAGTATGCAAGAAGGAAAAATTCATGATTTAATATTCTTTCTTGCCTACTCCTCCCATTCCATCTGCTTTCTGCGACTC 1 2 3' arm Populus_trichocarpa mirbase 100 ptc-MIR482 4e-56 -46.3 (((((.(((.((((...(((((.((((((((((.((((((((((((((((...)))))....))))))))))).)))).)))))))))))...)))).))).))))) (-46.30)