mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GATCTCTATACTTCTGTCAT TTGACAGAAGATAGAGAGCACGAATAATGAGGTGCTAATTGGAAGCTGCACCTTAATTCCTTGTGATCTCTATACTTCTGTCAT 2 1 5' arm Solanum_lycopersicum mirbase 100 sly-MIR156c 3e-22 -39.1 .((((((((((((((((.(((((..((((((((((............))))))).)))..))))).))))))).))))))))). (-39.10)