mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAACAA TGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 3 0 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR159 4e-85 ptc-MIR159b 0.0000000006 -73.7 (((((((((((..(((((((.(((..(((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..(((.((.((((((((..((((........)))))))))))).)).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))..))).)))))))..))))))))))) (-73.70)