mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCAAGCATA CAAGTCGTGTACACGTATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCAAAGCTCACCGTAATATATCGATGGGCCTTGTTGAATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCGATATCGTGTATATGATGTTG 3 0 5' arm Solanum_lycopersicum mirbase mir-160 5e-44 vvi-MIR160e 0.0000000000004 -63.3 ...((((((((((((.((((((.(((((((..(((((((((((((((.(((((.((........)).))))).))).))))))))))))..))))))).))))))........)))))))))))).... (-63.30)