mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTTGTTTTTGGCTATA GGTCTATAAGGTTTGCATGAAGTTGAAGAGAGTCAAGTTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGACCAAAAGTTGTGACCATTTTCTAGTTCCGGCAAGTTGTTTTTGGCTATAAGTTTGCTCTCTTCTTCTCATGTTATCCTCGTTAGACC 3 0 5' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR169_2 0.000009 vvi-MIR169s 0.000002 -69.3 ((((((..(((...((((((.(..(((((((((.((.(((.(((((((((..((((((((((.(.(((((.......)))))...).))))))))))..))))))))).))).)).)))))))))..)))))))...)))...)))))) (-69.30)