mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTACC TTTTAATTTGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTACCTTGACATGCTCTTTTCTTTTATGCAAGATATCTTTTCAAAATAGAAGTTTTAGTCATCGTTAAAATATCGAGACGGGGTTACAAGTCTTATTTAAAAGAAGAGAAGTCTAGCATGATGAGAAGAGTCTTATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCACCGTACTTGAAA 0 2 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR169_5 0.00000000005 ghb-MIR169a 0.0000000000002 -82.14 .(((((..((((..(((((((((((((((((((((.......(((((((((..((((((.((((.(((((((......((.(((((((......))))))).))(((((..(....)..)))))........))))))).)))).)))))).))))))))).......)))))))))))).))).)))))).))))...))))). (-82.14)