mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TATTGGCCTGGTTCACTCAGA TGAAACAGTAACTTTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGACAACAAAATGTAAACTATATTTGAATGGTTGAGTTTTCGTTTTTCGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTCAGTTTCTCTTTCA 2 0 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR171_1 5e-59 tcc-MIR171h 0.00000000003 -45.2 .((((.((.((((..(((((((((.(((((((.((((((((((((((...((((((......))))))..))))).)))....)))))).))))))).)))))))))..)))).)).)))). (-45.20)