mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG AGATATTGGTGCGGTTCAATT ACGAGATATTGGTGCGGTTCAATTAGAAAGCGCACTTCTTTATATATAGAACTTCGTTATTTAATTGAGCCGTGCCAATATCACGT 3 0 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR171_1 2e-42 aqc-MIR171f 0.00000000007 -41.9 (((.((((((((..(((((((((((((.((((...((((........))))...)))).)))))))))))))..)))))))).))) (-41.90)