mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTAGCATCATCAAGATTCATA ATGTAGCATCATCAAGATTCATACATGAAAATTAAGAGGCAAGGTTAAATATGTAGCTTTAATTTGAAATGAAAAATATAATATATCATGACCATGTCTATTTATTTCAAAGTGAGAATCTTGATGATGCTGCAT 1 0 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase mir-172 0.0000005 tcc-MIR172e 0.00000003 -47.5 ((((((((((((((((((((.(((.(((((......(((((.(((((...(((((......((((........))))....)))))..))))).))))).....)))))..))).)))))))))))))))))))) (-47.50)