mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGAACTCC AGTTCCCTTGACCACTTCATGA AGGGCTTACTTTGATGTTGGAAGCCTTGCTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCCGGGTTGACTTTGAAAATTACGCAAACAAGTATATATAAATGCATGAGTACGTATTAGCTAAAGATGATGAGTACAATATTGATTCATGTACCTTTGGAGTTCCCTTGACCACTTCATGAGAGCTTAATATTTGATTGTTTGAAGTCCT 4 0 5' arm Solanum_lycopersicum mirbase mir-395 9e-19 sly-MIR395b 8e-22 -62.8 (((((((((...(((((((..(((((((.(((((((.(..((((((((((.((((...(((((.....((((.(..((.((((......)))).))..).)))).....)))))...((((((.((....))))))))..))))..))))))))))..).))))))))))).)))))))))).....))...))))))) (-62.80)