mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGAACTCC AGTTCCCTTGACCACTTCATGA TTAAGGTGTTCCCTAGAGTTCCCTTGACCACTTCATGAGGGCTTACTTTGATGTTAGAAGCGTTGCTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGGTTGACTTTAA 5 0 3' arm Solanum_lycopersicum mirbase mir-395 2e-45 sly-MIR395a 4e-22 -45.7 .((((((...(((..(((((((((..(.(((((((..((.((((.((........)))))).))..))))))).)..)))))))))..)))...)))))). (-45.70)