mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAGTGCAGCGTTGATGA ATCAACGCTAAACTCGATCA CAGAGTACTTAGAAACATGATTGAGTGCAGCGTTGATGACATATTTGAGAAGTCCTGCATTTGGGCCTTCCTCATTTTTCATCAACGCTAAACTCGATCATGTTTTTAATTCTCTG 2 0 5' arm Solanum_lycopersicum mirbase MIR397 0.000006 vvi-MIR397a 0.000006 -56.6 (((((...((((((((((((((((((..(((((((((((...(..(((((((.(((......))).))).))))..).)))))))))))..))))))))))))))))))..))))) (-56.60)