mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGATGCAGCGGTTCATCGATC TGAAGTCACTGGATGCAGCGGTTCATCGATCTCTTCCTGAAATTGTTGTGAAAAAAGCAGATCAAGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGTTCACTCC 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR162_2 1e-43 cpa-MIR162a 2e-20 -41.7 ((((..(.((((((((((.((((.(((((((..(((.(((..(((((........))))).))).)))..))))))).)))).)))))))))).))))).... (-41.70)