mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGAGTCAAGGATGACTTGCCG GCAAGTTGACTTGACTCAGT AGGGTGGAATCGAGTCAAGGATGACTTGCCGATATATATTTGCGGAAGGACTTGCATGGGCCTTTAGCTATGTGTAACCGGCAAGTTGACTTGACTCAGTTTGGCCCTCT 3 1 5' arm Vitis_vinifera mirbase MIR169_2 6e-40 vvi-MIR169r 3e-41 -53.1 (((((.((((.((((((((...(((((((((.(((((((..((.(((((.(((....)))))))).)).)))))))..)))))))))..)))))))).)))).))))).. (-53.10)