mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGCGTCAATATC TATTGGCGTGCCTCAATTTAA TGGGGGGAGGTATTGGCGTGCCTCAATTTAAAGACATGGTTAGATGAAGAGATATTAGCCATGTGATTTGATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTTTGCA 2 0 3' arm Vitis_vinifera mirbase MIR171_1 4e-50 ctr-MIR171 0.00000000000002 -46.9 (..(((((((((((((((((.(((((((.((..((((((((((((......)).))))))))))..)).))))))).)))))))))))))))))..).. (-46.90)