mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCTATCCCTTAGGAAC GGTGGACAGTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCCATGGTTATCTTCCACCTCTCTTACCAGACTATCATAACAAAGTCTGGCCTTTTTCCCATTGGATCATGCTATCCCTTAGGAACTCTCCATCAG 2 1 5' arm Vitis_vinifera mirbase 100 vvi-MIR393b 0.000002 -53.9 ((((((.((((((.(((((((.((((.(((((.((((..(................(((((((..........))))))).....)..)))).))))))))).))))))).)))))).)))))).. (-53.90)