mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCAGGAGAGATGACACCGAC AGGTGTCATCTCCCCTGAACA TGCGTTCTTGTGGGGGGTTTGGGCCCTGTGATCAGGAGAGATGACACCGACATCGCCGGAATTCGTTCTTGGTCTTGTGCCATGATGAATTGATGGTCCGTTTGATGCAGGTGTCATCTCCCCTGAACATAGGACTGACTGACCCTGAATGGATGT TGGCAGAAGCACAGAAGAAGATACTACTACTACATAGTAGTACATAGCACTAGTATCTTCAGAGAGCAGGAAGAACATAGTAGATAGAGACATAGAGTGCGCCATGTATATCTGCAGTCTGCAGAGATGAGGGAGGATGTGCGTTCTTGTGGGGGGTTTGGGCCCTGTGATCAGGAGAGATGACACCGACATCGCCGGAATTCGTTCTTGGTCTTGTGCCATGATGAATTGATGGTCCGTTTGATGCAGGTGTCATCTCCCCTGAACATAGGACTGACTGACCCTGAATGGATGTGTACCTCGATGATTCTTCGGTTTCTTCTGTTCTGTTCTGTTCTTGATTTGCTTTTACAAGGTAATGCCTGATGCTAGTATGCAAATGTCAGCTTGTCTCCTCGATTGGTTTCTCTTTCCATGATTATC 4 0 5' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR1318 5e-84 -64.5 .((((((...(((((((((..((.((((((.(((((.(((((((((((..(((((.((((..(((.((.((((.....)))).)).....)))...))))..)))))..))))))))))).))))).)))))).))))))..)))))...)))))) (-64.5)