mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTCCTCTTTCTGTCAGC AGCTCCTGGTGTTGAGAGGGCCTCGAGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGTCCGGCATATGTATGCCGTCGTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGCCTCTTTCTCTCCGGAGTTTATCTTGCATCCAG 1 2 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-156 1e-23 osa-MIR156d 1e-32 -72.7 ((((((.((.(..((((((((.((....))..(((((((((((((((((((.((((((((....((((((....))))))))).))))).))))))))).))).))))))).))).))))).).)))))))).............. (-72.70)