mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCACGGAGCCAAGCATA AGAGACGAAGGTGAAGCTTATGTTGGGATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCACTCATCTATAGCAACATTCCTTCCTGATGAGGTTGCCTAGGATGGATGGCGTGCACGGAGCCAAGCATATCCCCCTTGATCCCAACCGTCTCTTCTCAT 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-160 1e-20 osa-MIR160c 6e-22 -71.5 (((((((..((.((...(((....(((((((((.(((((((.(((((((((..(((((...(((((..((......))....)))))...)))))..))))))))).))))))).)))))))))...)))))))...)))))))...... (-71.50)