mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCGG GGGCGCAGTGGTTTATCGATC GCCTGGGCGCAGTGGTTTATCGATCCTTTCCCTGCCTTGTGCTACTGATCCTGGGCCGGGCGGCGATTGGATACTTTTTTTCTTCTTGTCACAGCTTATGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCGGTT 3 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR162_2 0.0000000000005 osa-MIR162a 0.00000000000003 -55 ..((((..((((.((((((((((((..(((((.((((.((.(..........).)).))))(((((..(((.........)))..)))))...........)))))..)))))))))))).))))..)))).. (-55.00)