mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCTTCTTCTCCACC GAGTGGACATATGAGGCGAGGCGCGCGAGGTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTCGTTCCAGCTCGCCGCCGGTGTGCCGCGCCGCGGCCTGGGCGCGCGTGTCGCCCGAGCGGCCGGCCATGCGCGTGTGTGTGCATGCATGTGCCCTTCTTCTCCACCGCGCAAGCCTCGCCTGCGAACGCGCGCGCACGCC 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR164 0.00000000005 bdi-MIR164f 8e-22 -118.7 ..(((........(((((((((..(((.((((((((((.(((((((((((..........(((.((((((((.(((.(((((.(((.(....))))))))).)))))).))))).))).(((((((....)))))))))))))))))).)))))))))).)))..)))))))))(((......))).)))... (-118.70)