mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGTTCTTCTCCTCCATC AGCGAGAAGGACCGCGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCATGCAACTAGAGCTTAGCTAGTGTCAATTCTTCCATCTCTTGTGCCTGGCCGGGATCGATCTTATATACCGAGCTTAATTTGGCACCTATTGGATGCTGCATGCATGTGTTCTTCTCCTCCATCACGGTCTTCATTTCTCTCGCT 2 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR164 0.000000000003 bdi-MIR164b 5e-103 -80.96 ((((((((((((((.(.(((((.((.((((((((((((((((.((.(((((.......))))).........((((......(((((.((((((...............))).)))......)))))....)))).)))))))))))))))))).)).))))).).)))))))......))))))) (-80.96)