mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGCGCTCCCCTTCTCCACC TGGTGAGAATGCCCCTGTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAAAGATCGGAGCACGTTTCGTATGTGATGTACGTATGTGCATGGATCGCTGTGCACGCGCTCCCCTTCTCCACCATGGCCTTCTTACCA 3 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR164 0.00000003 ath-MIR164a 0.000000007 -67.6 .((((((((.(((..((.((((((((..((((.((((((..((((.(.((((((..(((((.....))))).)))))).).))))....)))))).))))..)))))))).)).))).)))))))). (-67.60)