mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGGGG GCTAGAGAGGGAGCCTTTTTCGTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGGGGTTCTCTTTATTTCTATGCCTCTCTCTATCCCCCCCTCCTCAATCTCTCTAGCTTTGATTGGATCGAGAGAAGATCGATCGATCGATCCAAGAAGAGTTCTGAGAAGGGGGATGAAGAGAGTAGACGTATGTGTGTAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAATACAAGGGCTCCCATGATCTCTGCCTC 4 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-166 0.0000000000003 osa-MIR166b 9e-16 -112.9 ((.(((((((((((((((.....((((.((((((((..((((((..(((((((..(..(((.((((...((((((.((((((((.........((((...((((((..(((((((((..((.......))..)))))))))..))))))..)))).)))))))).)))))))))).))).....)..)))))))..))))))..)))))))).))))...))))))))))....)))))))... (-112.90)