mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGTTCAAGG TGAAGATGTGAAGCTATTTTGCTTCTGGGTGGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTTGCCATGTGATTTGAGGATGAACGGTTTGTGCATGCATAACTTTCATTTCTCTTGTTTGCGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAGAGATAGCTTCAAACTCGAGATCTAGCC 4 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-166 0.0000000002 osa-MIR166a 4e-17 -70.4 ....((..((((((((((.....((((((.((((((..(((((((((.(((((((((.....(((..(((((((((.((((.(((....))))))))))).)))))..))).))))))))).)))))))))..)))))).))))))))))))))))...))........... (-70.40)