mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGTTGGAGA TCGCTGGTGCATGTATGGCGCAGTTGAGGGGAATGTTGTCTGGTTGGAGACCTAGCTAGCAGCTAGCACGGATCATCCATAGATCGATTCGACGCTGCATATGCGCGCGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAACTCTCAACTCGATCGATCTTCTTCGCTC 3 0 3' arm Brachypodium_distachyon mirbase mir-166 0.00000001 osa-MIR166c 0.00000000004 -67 ......((((.......)))).((((.((((((((..((((((((.((((((..(((((...))))).(((((((((....))).)))))).(((.((....))))).)))))).))))))))..)))))))).)))).........((.(((......))).)) (-67.00)