mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGCGGCAGCCTCACT GTGCTACTTACTTACTGCCCGAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCAGCGTGATCAAGCAAGATTCACACATACACGTGTGGTTTTTTTGAGCTATAGCTCGATTGATCTTGAGGTCATGCCTTGCTAGGTCATGCTGCGGCAGCCTCACTTCTTCCCGCCGTTTGGGCATGCACAGCTG 1 2 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR167_1 8e-19 osa-MIR167c 5e-20 -95.9 ((((...........((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((...((((((((...((((((((((((......)))))......((((((....))))))..))))))).))))))))...)))))))))))))..)))))).)))))).))))).....))))))).))))..... (-95.90)