mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAGGTTGTCCTTGGCTACA TTGCCATACGCTAAGAGGCAGAGAAGGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTGTTGGGGGAATTGCAGCTTTGTTGAGCCTTGAGTTAGCCGGCAGGTTGTCCTTGGCTACACCTAGTTCTCTTCTTCTGGTGTTTGGCCCT 3 0 5' arm Brachypodium_distachyon mirbase MIR169_2 2e-25 osa-MIR169c 6e-25 -79.1 ..((((.((((((.((((.((((((.(((.((.(((((((((..((((((((((((((......))).........((((....))))........)))))))))))..))))))))).)))))..)))))).)))))))))).))))... (-79.10)